More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0589 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  79.73 
 
 		 670 aa  954    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 684 aa  1337    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  95.47 
 
 		 684 aa  1212    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  56.9 
 
 		 635 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  53.31 
 
 		 652 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  53.6 
 
 		 653 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 958 aa  312  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 		 662 aa  300  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  31.17 
 
 		 731 aa  290  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 		 710 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 765 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 		 733 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 1486 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 717 aa  283  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 709 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 709 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 		 1359 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  41.47 
 
 		 531 aa  275  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 717 aa  275  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 625 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 625 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  40.14 
 
 		 602 aa  273  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.03 
 
 		 610 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 1509 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 		 632 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 1275 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 1152 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 1152 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 721 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 775 aa  260  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 		 539 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 		 728 aa  259  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  42.78 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 		 555 aa  257  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 1334 aa  256  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 		 1759 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  37.71 
 
 		 586 aa  253  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 617 aa  253  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 746 aa  250  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 		 551 aa  248  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 1067 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 625 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  42.18 
 
 		 551 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 723 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 576 aa  241  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  38.48 
 
 		 796 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.64 
 
 		 809 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 794 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.09 
 
 		 1644 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 832 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.09 
 
 		 1644 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  37.47 
 
 		 808 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.56 
 
 		 1561 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  38.7 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 988 aa  229  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 880 aa  228  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  30.74 
 
 		 810 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 		 742 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 742 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 742 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 		 732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 996 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 983 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 725 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 857 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  36.42 
 
 		 725 aa  208  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 		 1991 aa  207  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  31.17 
 
 		 1182 aa  207  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 783 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 734 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 556 aa  203  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 729 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.41 
 
 		 1198 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 1297 aa  193  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 748 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 1193 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 1188 aa  188  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 958 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0914  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 		 669 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 790 aa  177  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.35 
 
 		 1173 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 		 1191 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 1213 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 1084 aa  167  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 1162 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 2046 aa  163  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1694 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 1187 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 968 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.21 
 
 		 968 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 		 1177 aa  157  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 974 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 1190 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1171 aa  151  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  39.76 
 
 		 1003 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 1386 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  24.02 
 
 		 783 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>