More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4260 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  53.42 
 
 		 732 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  92.05 
 
 		 742 aa  1348    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  97.3 
 
 		 742 aa  1448    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 742 aa  1489    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  51.59 
 
 		 725 aa  611  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  51.04 
 
 		 725 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 958 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  39.61 
 
 		 1152 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 		 1152 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 		 1067 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 734 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 		 746 aa  401  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 1275 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 		 625 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 		 625 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  40.91 
 
 		 1182 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  36.85 
 
 		 733 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  31.33 
 
 		 731 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 		 996 aa  382  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 1334 aa  379  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 1991 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 		 988 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 		 717 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 1509 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 		 710 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 717 aa  365  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 709 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 709 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 625 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 		 857 aa  348  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.95 
 
 		 1561 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 832 aa  347  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 		 790 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 983 aa  337  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 1486 aa  334  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 		 794 aa  329  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  35.46 
 
 		 783 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 775 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 		 728 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 880 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  31.58 
 
 		 810 aa  300  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 1084 aa  299  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 2046 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 658 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 958 aa  243  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.56 
 
 		 1644 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.56 
 
 		 1644 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 602 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 684 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.71 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 		 1074 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 617 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 		 1009 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 684 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 670 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 1359 aa  194  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 653 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 662 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 872 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 		 531 aa  180  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 652 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 635 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 808 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 1297 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 1759 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 510 aa  167  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 		 809 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 1213 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 555 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 729 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  28.6 
 
 		 556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 551 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 551 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.83 
 
 		 632 aa  154  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 		 748 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 1188 aa  145  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 1193 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  31.24 
 
 		 783 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1694 aa  134  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  32.4 
 
 		 1003 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.96 
 
 		 1191 aa  131  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 		 1162 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 784 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 1198 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 1190 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.99 
 
 		 1173 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 		 1386 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.78 
 
 		 968 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 974 aa  119  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  24.96 
 
 		 1192 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1171 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>