More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0402 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  100 
 
 
1644 aa  3369    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  99.94 
 
 
1644 aa  3365    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  56.99 
 
 
725 aa  747    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
1486 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
1275 aa  295  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
832 aa  293  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  30.78 
 
 
1509 aa  293  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
988 aa  290  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
958 aa  287  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
625 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
625 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  52.17 
 
 
342 aa  285  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
723 aa  285  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
1067 aa  282  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
746 aa  282  4e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
733 aa  281  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
1152 aa  281  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.8 
 
 
1561 aa  280  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
1152 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
625 aa  273  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
765 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
617 aa  268  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
632 aa  263  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
728 aa  262  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
602 aa  261  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
721 aa  258  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  30.75 
 
 
731 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  28.3 
 
 
1182 aa  254  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
983 aa  253  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
996 aa  253  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
775 aa  253  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
652 aa  251  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
794 aa  251  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
725 aa  250  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
1297 aa  249  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
734 aa  249  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
725 aa  249  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  54.55 
 
 
409 aa  248  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
658 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
1991 aa  248  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
732 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
710 aa  245  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
717 aa  244  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
709 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
709 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
1334 aa  243  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
717 aa  239  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
742 aa  238  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
684 aa  238  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
742 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
857 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
653 aa  235  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
742 aa  232  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
729 aa  227  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.03 
 
 
610 aa  224  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
684 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
880 aa  222  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
586 aa  222  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
958 aa  222  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
670 aa  221  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  41.62 
 
 
447 aa  218  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  39.94 
 
 
879 aa  218  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.45 
 
 
809 aa  215  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  26.08 
 
 
783 aa  215  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  33.27 
 
 
1084 aa  214  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
808 aa  214  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
790 aa  212  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
576 aa  209  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  50.67 
 
 
243 aa  207  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  40.71 
 
 
456 aa  207  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  48 
 
 
249 aa  207  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  48 
 
 
249 aa  207  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  50.22 
 
 
459 aa  206  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  49.33 
 
 
785 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  45.95 
 
 
265 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
1759 aa  202  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
3301 aa  202  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
2046 aa  201  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.24 
 
 
662 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  41.08 
 
 
314 aa  197  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 
635 aa  196  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
748 aa  195  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
531 aa  195  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.66 
 
 
632 aa  194  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
774 aa  194  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
1359 aa  193  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  32.15 
 
 
796 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  35.6 
 
 
444 aa  192  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
551 aa  191  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  27.36 
 
 
810 aa  191  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  44.44 
 
 
271 aa  190  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
551 aa  188  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
555 aa  188  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  36.47 
 
 
477 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  39.24 
 
 
320 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
526 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
539 aa  185  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  34.55 
 
 
787 aa  178  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 
856 aa  175  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
1213 aa  175  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>