More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2031 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  54.49 
 
 
972 aa  1003    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  100 
 
 
1003 aa  2037    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.3 
 
 
1030 aa  266  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
610 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
1486 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
958 aa  188  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
733 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
632 aa  178  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
1334 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
996 aa  174  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  30.02 
 
 
832 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
746 aa  172  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 
880 aa  171  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
983 aa  171  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  33.97 
 
 
1182 aa  167  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
710 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
988 aa  164  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  29.89 
 
 
731 aa  161  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
1152 aa  161  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
709 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
1152 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
709 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 
717 aa  159  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
775 aa  156  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
717 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
1275 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  33.43 
 
 
1359 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 
723 aa  154  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
748 aa  154  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
684 aa  154  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 
1509 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
1067 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
796 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
625 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  26.67 
 
 
810 aa  148  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
602 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
617 aa  147  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
1759 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
586 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
670 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
658 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
576 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
790 aa  145  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 
1561 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  39.76 
 
 
684 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 
783 aa  142  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.98 
 
 
632 aa  140  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
808 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
729 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
531 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  38.37 
 
 
652 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  38.96 
 
 
662 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
725 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
653 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
635 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
721 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
742 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
742 aa  135  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
742 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 
809 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
958 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
794 aa  134  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  30.02 
 
 
725 aa  132  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
732 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
555 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.79 
 
 
1644 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.79 
 
 
1644 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
765 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
728 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.2 
 
 
326 aa  125  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
551 aa  122  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
1991 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
1188 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
539 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.07 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
857 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
551 aa  118  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
1198 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
1084 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.76 
 
 
2401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
525 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
556 aa  108  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
510 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
1297 aa  107  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
853 aa  106  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
1435 aa  104  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
1044 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
1173 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.92 
 
 
968 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  27.24 
 
 
321 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
1386 aa  99.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
1739 aa  98.6  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.74 
 
 
1191 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.51 
 
 
305 aa  97.8  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
965 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
968 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>