More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1947 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 968 aa  1975    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  77.53 
 
 		 968 aa  1537    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  48.76 
 
 		 974 aa  940    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  50.11 
 
 		 965 aa  889    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 		 1759 aa  446  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  33.65 
 
 		 905 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 1359 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 		 1188 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.26 
 
 		 1173 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1171 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  38.56 
 
 		 1177 aa  356  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 1162 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 1187 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  36.45 
 
 		 1165 aa  308  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  36.45 
 
 		 1165 aa  308  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 1193 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 1198 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 1190 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.11 
 
 		 1191 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  34.32 
 
 		 1694 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 1192 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 1486 aa  218  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 746 aa  213  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  25.99 
 
 		 731 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 733 aa  195  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 709 aa  194  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 709 aa  194  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 1213 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 1275 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 		 958 aa  191  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 1067 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 765 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 		 832 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 		 1509 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 1152 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 1152 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 625 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 1334 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 602 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 		 610 aa  170  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 988 aa  170  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 625 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 625 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 658 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  25.84 
 
 		 783 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 684 aa  157  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 723 aa  157  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.06 
 
 		 1561 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 794 aa  155  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 635 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  27.65 
 
 		 1182 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 670 aa  152  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 729 aa  151  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 586 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 576 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 		 556 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 		 996 aa  146  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 531 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 551 aa  145  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 551 aa  144  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 		 710 aa  144  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 539 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 617 aa  142  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  26.86 
 
 		 810 aa  140  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 1991 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 526 aa  138  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.95 
 
 		 1644 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.95 
 
 		 1644 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 684 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 983 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 717 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 717 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 783 aa  134  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 2046 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 721 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 808 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 857 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 1084 aa  126  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 652 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 653 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 662 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  28.54 
 
 		 775 aa  121  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 784 aa  121  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 796 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
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NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 742 aa  118  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
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NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 742 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 809 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
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NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 		 742 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 958 aa  111  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  25.74 
 
 		 632 aa  109  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 732 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
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NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
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NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 1297 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 725 aa  100  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
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