More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4626 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
742 aa  1488    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  92.05 
 
 
742 aa  1346    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  53.28 
 
 
732 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  97.3 
 
 
742 aa  1422    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  51.18 
 
 
725 aa  611  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  51.73 
 
 
725 aa  611  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
958 aa  445  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  39.96 
 
 
1152 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  40.14 
 
 
1152 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
765 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 
1067 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  35.99 
 
 
746 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
734 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
632 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 
723 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  32.29 
 
 
731 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  40.39 
 
 
625 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  40.39 
 
 
625 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 
1275 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
733 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  40.71 
 
 
1182 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
996 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  35.3 
 
 
1334 aa  382  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  39.93 
 
 
988 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  38.76 
 
 
1991 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
709 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
1509 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
709 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
721 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  39.04 
 
 
717 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  38.88 
 
 
710 aa  364  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  38.88 
 
 
717 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
625 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
857 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
832 aa  353  5e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
790 aa  347  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.88 
 
 
1561 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
1486 aa  338  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 
983 aa  337  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 
794 aa  333  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  35.66 
 
 
783 aa  327  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  37.48 
 
 
775 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
728 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
880 aa  301  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
1084 aa  298  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  31.83 
 
 
810 aa  297  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
2046 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
658 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
958 aa  247  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.94 
 
 
1644 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.94 
 
 
1644 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
602 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.94 
 
 
610 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
684 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
1074 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
1009 aa  204  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
684 aa  202  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
1359 aa  193  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
662 aa  189  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
670 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.79 
 
 
652 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
872 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
531 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
808 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
1759 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
796 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
635 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
1213 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
1297 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
576 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
539 aa  170  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
510 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.26 
 
 
809 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
555 aa  163  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
551 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
551 aa  156  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
729 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  29.8 
 
 
632 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
748 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
1193 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 
1188 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
783 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  35.66 
 
 
1003 aa  132  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.93 
 
 
1191 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 
1162 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
784 aa  129  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  26.57 
 
 
1694 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
1386 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
1198 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
1190 aa  124  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
974 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 
1173 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  29.06 
 
 
972 aa  120  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
1192 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.17 
 
 
968 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>