More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1482 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 1188 aa  636    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1162 aa  2360    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  36.34 
 
 		 1187 aa  710    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 		 1359 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  45.05 
 
 		 1759 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 		 1213 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  42.99 
 
 		 1171 aa  596  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 		 1177 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.13 
 
 		 1173 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  40.4 
 
 		 1165 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  40.4 
 
 		 1165 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.79 
 
 		 1191 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 1198 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 1193 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 		 1190 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 1192 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  40.15 
 
 		 1694 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 		 974 aa  352  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  39.23 
 
 		 968 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 968 aa  337  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  40.36 
 
 		 965 aa  304  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 602 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 1509 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 709 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 709 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1883  hypothetical protein  39.72 
 
 		 372 aa  196  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 1486 aa  195  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 746 aa  195  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 733 aa  195  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 958 aa  194  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 1275 aa  194  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.21 
 
 		 731 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  33.26 
 
 		 905 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  39.07 
 
 		 1121 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  37.59 
 
 		 928 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 610 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 632 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0142  hypothetical protein  37.37 
 
 		 928 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 734 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 		 1152 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  23.09 
 
 		 1152 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 625 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 625 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.41 
 
 		 684 aa  175  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 1067 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 765 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 625 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 		 832 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 		 1561 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 556 aa  165  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 		 670 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 723 aa  162  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 		 1334 aa  160  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.8 
 
 		 1644 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.8 
 
 		 1644 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 996 aa  160  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 652 aa  157  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  27.79 
 
 		 742 aa  156  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 576 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 684 aa  155  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.39 
 
 		 632 aa  155  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  26.77 
 
 		 1182 aa  155  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 635 aa  154  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 653 aa  151  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 725 aa  151  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 		 717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  37.18 
 
 		 710 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 658 aa  148  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 808 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 		 717 aa  146  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 		 721 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 		 742 aa  146  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 742 aa  144  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 		 809 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 732 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 725 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 775 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 728 aa  141  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 662 aa  141  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  28.2 
 
 		 2046 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 988 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 729 aa  138  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 1991 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 551 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 796 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 617 aa  130  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 551 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  32.15 
 
 		 783 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 857 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 958 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 794 aa  130  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 555 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0347  hypothetical protein  31.56 
 
 		 347 aa  127  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.337715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 526 aa  125  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 531 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 790 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 539 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  24.66 
 
 		 810 aa  121  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>