More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3926 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1509 aa  3120    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.66 
 
 		 1561 aa  1771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  56.62 
 
 		 632 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  50.27 
 
 		 723 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  55 
 
 		 625 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  56.33 
 
 		 625 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  56.33 
 
 		 625 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  56.29 
 
 		 958 aa  628  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  54.13 
 
 		 1275 aa  621  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  54.85 
 
 		 709 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  54.85 
 
 		 709 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  52.39 
 
 		 731 aa  588  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  51.65 
 
 		 996 aa  559  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  50.47 
 
 		 733 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  45.88 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 		 1334 aa  539  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  44.92 
 
 		 1152 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  45.76 
 
 		 1152 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  47.29 
 
 		 1067 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  47.76 
 
 		 721 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  43.49 
 
 		 602 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 		 658 aa  509  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  46.51 
 
 		 710 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  42.62 
 
 		 746 aa  494  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  46.1 
 
 		 717 aa  492  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  48.66 
 
 		 775 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  45.92 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  39.31 
 
 		 1991 aa  472  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  43.45 
 
 		 790 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  44.65 
 
 		 728 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  40.84 
 
 		 832 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 		 1486 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 		 734 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  41.71 
 
 		 1084 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 988 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  40.49 
 
 		 880 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  33.94 
 
 		 1182 aa  400  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 		 857 aa  392  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 		 983 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  38.9 
 
 		 794 aa  389  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  37.95 
 
 		 742 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 		 996 aa  379  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.32 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 742 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  37.18 
 
 		 810 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  37.34 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  37.75 
 
 		 783 aa  360  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 		 958 aa  340  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 		 576 aa  332  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  35.02 
 
 		 2046 aa  296  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.78 
 
 		 1644 aa  293  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.78 
 
 		 1644 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 796 aa  290  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 808 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 586 aa  286  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 1359 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.89 
 
 		 809 aa  285  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 617 aa  279  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 		 556 aa  270  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 732 aa  270  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 684 aa  268  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  39 
 
 		 555 aa  264  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 		 1759 aa  261  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  34.28 
 
 		 565 aa  257  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 551 aa  254  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 729 aa  252  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 1009 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 684 aa  249  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 531 aa  248  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 526 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  31.81 
 
 		 725 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 551 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 725 aa  244  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  34.85 
 
 		 632 aa  241  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 539 aa  241  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 		 652 aa  240  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 653 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 670 aa  236  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  28.59 
 
 		 1213 aa  233  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 		 635 aa  232  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 783 aa  232  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 662 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 1193 aa  220  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 1198 aa  214  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 		 1074 aa  208  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 		 784 aa  207  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 748 aa  207  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 1297 aa  201  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 1171 aa  199  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 1190 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.93 
 
 		 1191 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1694 aa  193  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 1188 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 1162 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.07 
 
 		 1173 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 1187 aa  182  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.16 
 
 		 968 aa  182  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 974 aa  182  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 1177 aa  182  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 968 aa  181  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>