More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1508 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.43 
 
 		 1191 aa  1413    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  57.35 
 
 		 1190 aa  1415    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  37.7 
 
 		 1165 aa  653    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1198 aa  2456    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 		 1177 aa  718    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  53.46 
 
 		 1193 aa  1275    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1694 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1171 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  50.83 
 
 		 1192 aa  1141    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 		 1188 aa  769    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  37.7 
 
 		 1165 aa  653    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  42.03 
 
 		 1359 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 1759 aa  685    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 		 1187 aa  616  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.58 
 
 		 1173 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 1162 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 1213 aa  452  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 968 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 		 968 aa  296  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 974 aa  280  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  34.6 
 
 		 731 aa  241  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 746 aa  238  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 965 aa  237  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 958 aa  230  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  33.41 
 
 		 765 aa  227  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 		 733 aa  225  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 1275 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 		 602 aa  219  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 1509 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.92 
 
 		 610 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 709 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 709 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 1486 aa  212  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 625 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 832 aa  207  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 625 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 625 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 658 aa  204  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 734 aa  201  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 576 aa  201  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 880 aa  200  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 684 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 		 1561 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 728 aa  197  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 		 670 aa  197  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 710 aa  196  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  30.78 
 
 		 723 aa  195  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 		 684 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 794 aa  191  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  29.8 
 
 		 810 aa  191  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 635 aa  191  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 717 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 717 aa  189  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 652 aa  189  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 1334 aa  186  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 721 aa  184  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  32.86 
 
 		 905 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 729 aa  180  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 1152 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 1991 aa  179  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  30.02 
 
 		 617 aa  179  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 1067 aa  179  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 1152 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 556 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 551 aa  175  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 775 aa  171  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 988 aa  169  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 551 aa  168  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 796 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 662 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 996 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 		 653 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  28.78 
 
 		 1182 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 586 aa  158  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.31 
 
 		 809 aa  158  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 808 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 555 aa  157  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  28.84 
 
 		 2046 aa  155  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 783 aa  154  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 531 aa  154  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  34.69 
 
 		 632 aa  152  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.67 
 
 		 1644 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.67 
 
 		 1644 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 539 aa  152  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 983 aa  152  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 526 aa  151  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  29.33 
 
 		 783 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 958 aa  150  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 857 aa  149  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 725 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 748 aa  141  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 		 784 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 725 aa  138  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  26.31 
 
 		 742 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 1297 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 1084 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 732 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 742 aa  126  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 742 aa  126  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>