133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1477 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  100 
 
 		 905 aa  1814    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 974 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 968 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  37.03 
 
 		 965 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.58 
 
 		 968 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 1759 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 1188 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1171 aa  217  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 1359 aa  208  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.62 
 
 		 1173 aa  207  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 1187 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 1177 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 1193 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 1198 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  34.28 
 
 		 1165 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  34.28 
 
 		 1165 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 1190 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  33.26 
 
 		 1162 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 1192 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 		 1191 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 1486 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1694 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 832 aa  124  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 632 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  24.94 
 
 		 1067 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 1213 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 1509 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 1152 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 1275 aa  111  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 1152 aa  111  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  27.09 
 
 		 731 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 794 aa  108  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  24.94 
 
 		 958 aa  108  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 625 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 625 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 733 aa  108  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 		 765 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.95 
 
 		 610 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.57 
 
 		 1644 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.57 
 
 		 1644 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 617 aa  104  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 723 aa  103  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 2046 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 602 aa  100  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  24.37 
 
 		 783 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 717 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.89 
 
 		 1561 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 		 988 aa  96.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 555 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 717 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 551 aa  89  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 1334 aa  89.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 734 aa  89  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 625 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 635 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  22.44 
 
 		 790 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 		 857 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 983 aa  85.5  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 658 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 880 aa  84  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 		 742 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 1297 aa  81.6  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 728 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 684 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 721 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 808 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 		 1084 aa  77.8  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.38 
 
 		 632 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 		 576 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 996 aa  76.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 742 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 732 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 796 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 725 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 725 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
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NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 662 aa  72  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
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NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.57 
 
 		 2401 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.98 
 
 		 809 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
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NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 526 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
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NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  23.34 
 
 		 958 aa  69.7  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 1340 aa  67.4  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  28.32 
 
 		 1182 aa  67.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 1991 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 775 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
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NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  23.28 
 
 		 810 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 289 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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