More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00983 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 
1193 aa  722    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.12 
 
 
1173 aa  746    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.34 
 
 
1191 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  41.43 
 
 
1188 aa  924    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  37.49 
 
 
1190 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  100 
 
 
1165 aa  2353    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  61.58 
 
 
1171 aa  1377    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  52.7 
 
 
1759 aa  858    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 
1198 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  58.61 
 
 
1177 aa  1379    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  100 
 
 
1165 aa  2353    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 
1187 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  46.97 
 
 
1359 aa  769    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  46.75 
 
 
1694 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
1192 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
1162 aa  539  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
974 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
1213 aa  333  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
968 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.45 
 
 
968 aa  317  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 
965 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
1486 aa  197  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  34.28 
 
 
905 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
733 aa  188  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
632 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
602 aa  183  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
1275 aa  184  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.07 
 
 
731 aa  171  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
1067 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
958 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
1509 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
625 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
625 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
393 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
734 aa  162  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
709 aa  162  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
709 aa  162  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
1152 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
1152 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
531 aa  158  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
765 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 
610 aa  153  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
551 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
539 aa  149  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
746 aa  149  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
684 aa  148  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
880 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
625 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
555 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
670 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
551 aa  145  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.14 
 
 
1561 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
617 aa  144  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
721 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 
717 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
717 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  27.93 
 
 
783 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
635 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
710 aa  140  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.84 
 
 
1644 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
526 aa  139  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.84 
 
 
1644 aa  139  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
556 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 
996 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
775 aa  135  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
1334 aa  134  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  29.23 
 
 
810 aa  134  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
652 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
653 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
723 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
1991 aa  131  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
684 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
729 aa  128  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
832 aa  126  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
988 aa  126  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
662 aa  124  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
732 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  27.99 
 
 
2046 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
725 aa  121  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  25.97 
 
 
632 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
586 aa  120  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
728 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
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NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  29.21 
 
 
1182 aa  119  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
658 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
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NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
983 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
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NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
725 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
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NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
808 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
796 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
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NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.79 
 
 
809 aa  115  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
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NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.51 
 
 
853 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.99 
 
 
853 aa  112  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.83 
 
 
851 aa  111  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
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NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 
851 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 
851 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  28.93 
 
 
851 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 
851 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
783 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0914  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
669 aa  110  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.357692 
 
 
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