More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2836 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1759 aa  3580    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.98 
 
 		 1173 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.82 
 
 		 1191 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  41.96 
 
 		 1190 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 		 1198 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  51.57 
 
 		 1188 aa  992    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  44.47 
 
 		 1193 aa  730    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  54.32 
 
 		 1177 aa  941    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  52.7 
 
 		 1165 aa  858    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  47.23 
 
 		 1694 aa  1297    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  57.37 
 
 		 1171 aa  961    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 		 1162 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 		 1187 aa  838    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  59.4 
 
 		 1359 aa  1055    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  52.7 
 
 		 1165 aa  858    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  41.02 
 
 		 1192 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  47.58 
 
 		 974 aa  490  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  46.84 
 
 		 968 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.4 
 
 		 968 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 		 1213 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  44.75 
 
 		 965 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 958 aa  302  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  36.27 
 
 		 731 aa  301  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 		 709 aa  291  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 		 709 aa  291  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 1486 aa  291  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 		 765 aa  285  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 632 aa  280  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 733 aa  278  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 		 1275 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 		 602 aa  276  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 		 1509 aa  269  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 1152 aa  264  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 684 aa  262  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 1152 aa  261  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 723 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 625 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 625 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 		 576 aa  255  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 		 746 aa  253  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 832 aa  252  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 		 1334 aa  252  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  47.84 
 
 		 670 aa  251  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 1067 aa  251  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 880 aa  248  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.07 
 
 		 610 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.9 
 
 		 1561 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 		 625 aa  246  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 728 aa  246  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  37.42 
 
 		 710 aa  245  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 		 717 aa  240  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 		 684 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 717 aa  236  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 721 aa  234  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  44.57 
 
 		 652 aa  235  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 1991 aa  234  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 		 526 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  36.4 
 
 		 905 aa  233  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 658 aa  232  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  41.97 
 
 		 808 aa  231  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 988 aa  231  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  38.82 
 
 		 531 aa  228  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  34.8 
 
 		 1182 aa  226  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 586 aa  226  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  45.68 
 
 		 635 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 		 617 aa  224  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  43.05 
 
 		 796 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  45.49 
 
 		 775 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 783 aa  221  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  43.26 
 
 		 632 aa  220  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 996 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 539 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.5 
 
 		 809 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 729 aa  218  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 		 653 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 		 551 aa  215  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 		 662 aa  210  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.43 
 
 		 1644 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.43 
 
 		 1644 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 551 aa  209  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 		 556 aa  209  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 		 555 aa  209  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  31.32 
 
 		 810 aa  204  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 790 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 857 aa  198  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 		 784 aa  194  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 958 aa  193  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 734 aa  192  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 725 aa  183  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 732 aa  183  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 983 aa  182  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 725 aa  181  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 794 aa  179  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 742 aa  178  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 742 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 1297 aa  174  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 742 aa  171  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 1084 aa  165  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 2046 aa  162  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 748 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>