More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3720 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  39.1 
 
 		 1165 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 		 1188 aa  752    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  47.34 
 
 		 1192 aa  1060    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.71 
 
 		 1191 aa  1254    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  52.71 
 
 		 1190 aa  1266    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  53.12 
 
 		 1198 aa  1258    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  44.21 
 
 		 1759 aa  693    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 		 1177 aa  752    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1193 aa  2440    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1171 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  39.1 
 
 		 1165 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  40.88 
 
 		 1359 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  44.77 
 
 		 1694 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 		 1173 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 		 1187 aa  566  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 1162 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 		 1213 aa  429  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 		 968 aa  303  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.77 
 
 		 968 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 974 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 765 aa  264  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 709 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 709 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 733 aa  235  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 965 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 		 1275 aa  234  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 958 aa  231  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 632 aa  225  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 746 aa  224  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  31.2 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 		 602 aa  221  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 1509 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 625 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 1486 aa  219  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 625 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 710 aa  210  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 625 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 658 aa  205  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.65 
 
 		 610 aa  204  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 880 aa  201  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 1152 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 		 1561 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 1152 aa  198  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 832 aa  197  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 1067 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 717 aa  195  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 717 aa  194  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 728 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  30.02 
 
 		 734 aa  192  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  25.61 
 
 		 810 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 684 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 576 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 996 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 1334 aa  185  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 539 aa  186  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 723 aa  184  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  29.98 
 
 		 1991 aa  184  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  33.97 
 
 		 905 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 635 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 		 556 aa  175  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 670 aa  172  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 551 aa  170  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 684 aa  166  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 775 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 653 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 555 aa  163  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 794 aa  163  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 526 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 551 aa  162  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 		 531 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 796 aa  158  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 857 aa  156  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 783 aa  156  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  27.79 
 
 		 790 aa  155  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.09 
 
 		 632 aa  154  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  27.72 
 
 		 1182 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 988 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 		 809 aa  149  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 983 aa  148  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 652 aa  148  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 586 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 742 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 808 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 729 aa  145  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 742 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 742 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 662 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 725 aa  138  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  23.73 
 
 		 783 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 784 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 725 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 617 aa  136  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.02 
 
 		 1644 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.02 
 
 		 1644 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 2046 aa  135  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 732 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0914  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 669 aa  125  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 1297 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.58 
 
 		 2401 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>