251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1793 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 862 aa  1768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  58.27 
 
 		 827 aa  943    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  63.85 
 
 		 852 aa  1076    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 1314 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 1312 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 1287 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 1185 aa  217  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1444 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  41.48 
 
 		 818 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  41.82 
 
 		 1673 aa  203  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 		 814 aa  201  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 818 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 		 1322 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 		 1256 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 746 aa  195  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 		 1313 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 1035 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 987 aa  183  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 1059 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 		 1317 aa  181  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  43.5 
 
 		 953 aa  179  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  31.8 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 		 995 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 850 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  38.87 
 
 		 1008 aa  151  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 1600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 680 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 1523 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 785 aa  91.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 1162 aa  92  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 369 aa  90.9  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 1523 aa  89.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 624 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  28.94 
 
 		 387 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 703 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.88 
 
 		 860 aa  81.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 1268 aa  81.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.41 
 
 		 2401 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 1106 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 1435 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 994 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  29.7 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 616 aa  77.4  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 298 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 902 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.44 
 
 		 1119 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 658 aa  72  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 1077 aa  70.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 576 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 700 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 314 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 		 1739 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.37 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 1152 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.63 
 
 		 297 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 1340 aa  66.6  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 293 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  23.21 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.67 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 355 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.19 
 
 		 284 aa  63.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 330 aa  63.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 318 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 658 aa  63.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 		 602 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 1267 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.72 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 350 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.38 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  20.82 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  21.81 
 
 		 970 aa  60.1  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 		 892 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 299 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>