More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6296 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
814 aa  1681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  40.41 
 
 
1673 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
1312 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
1313 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
1059 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
1035 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
987 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
1322 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
995 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
1287 aa  412  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 
1314 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  36.93 
 
 
1444 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
746 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
1317 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
1256 aa  323  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
1185 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
1008 aa  288  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
953 aa  266  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.63 
 
 
862 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 
827 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
852 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  40.96 
 
 
818 aa  190  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
850 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  38.69 
 
 
723 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
818 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  33.91 
 
 
597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
1523 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
1523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
369 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
1435 aa  99  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
1067 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
680 aa  95.9  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
1600 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
1162 aa  89.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  28.79 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
1268 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
624 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
679 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.35 
 
 
1119 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
1340 aa  82.4  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
785 aa  82  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  47.19 
 
 
746 aa  75.5  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  28.7 
 
 
279 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
817 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
994 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
1264 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  42.68 
 
 
644 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.06 
 
 
1806 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2171  hypothetical protein  24.35 
 
 
711 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.201556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  43.84 
 
 
115 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  41.49 
 
 
137 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  36.11 
 
 
1632 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  44.16 
 
 
678 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 
665 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
457 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
270 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
616 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  42.47 
 
 
120 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  46.58 
 
 
137 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  27.56 
 
 
592 aa  64.3  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
1067 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
355 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
441 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  40.28 
 
 
361 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
413 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  41.49 
 
 
521 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  39.29 
 
 
849 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  43.66 
 
 
322 aa  62  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.77 
 
 
700 aa  62  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  26.28 
 
 
1147 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.21 
 
 
1161 aa  61.2  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  42.25 
 
 
227 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
1077 aa  61.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  41.77 
 
 
2796 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
1400 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  45.21 
 
 
137 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 
1152 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
361 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  33.96 
 
 
255 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  38.64 
 
 
1247 aa  60.1  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
361 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 
1152 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
327 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  43.84 
 
 
2342 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
280 aa  59.3  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  43.84 
 
 
2342 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
1106 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
872 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  24.65 
 
 
413 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  29.01 
 
 
360 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  44 
 
 
294 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
1303 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
377 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  41.33 
 
 
294 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  44 
 
 
294 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
312 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
447 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
312 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
924 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
354 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>