171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1204 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  42.83 
 
 		 995 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 1059 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 		 1035 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1322 aa  2628    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  88.16 
 
 		 1313 aa  2085    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 		 987 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 		 814 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  37.97 
 
 		 1673 aa  380  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1444 aa  332  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 		 1312 aa  323  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 		 1287 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 746 aa  308  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 1317 aa  308  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 1314 aa  307  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 1185 aa  266  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 1256 aa  252  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 953 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 		 1008 aa  201  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.82 
 
 		 862 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 		 827 aa  198  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 		 852 aa  195  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  29.9 
 
 		 723 aa  172  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 		 818 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 818 aa  167  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 850 aa  154  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  27.2 
 
 		 849 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 		 1067 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 665 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  31.71 
 
 		 597 aa  101  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 857 aa  98.6  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 1523 aa  97.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 		 1247 aa  96.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 1523 aa  93.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 1044 aa  92.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.23 
 
 		 1366 aa  92  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 872 aa  91.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 1268 aa  88.2  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 1600 aa  86.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 1435 aa  86.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  32.26 
 
 		 2796 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  39.26 
 
 		 1632 aa  85.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 785 aa  84.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  31.49 
 
 		 521 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  29.96 
 
 		 2342 aa  81.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  29.96 
 
 		 2342 aa  81.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 680 aa  81.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.82 
 
 		 916 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.24 
 
 		 1806 aa  80.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  26.03 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 1162 aa  78.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.62 
 
 		 1119 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 1340 aa  75.5  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 		 756 aa  74.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 1264 aa  74.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 994 aa  73.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  30.69 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 1067 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  69.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  48.48 
 
 		 120 aa  68.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 658 aa  67.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  48.48 
 
 		 115 aa  67  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 1152 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 1152 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 		 817 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  34.91 
 
 		 305 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27 
 
 		 860 aa  63.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  42.53 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 315 aa  62  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.76 
 
 		 315 aa  62  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 		 361 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  43.08 
 
 		 227 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  37.8 
 
 		 361 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  37.97 
 
 		 137 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 1106 aa  59.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  27.22 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  41.54 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  40 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  39.51 
 
 		 1476 aa  58.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 602 aa  58.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 334 aa  57.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  25.73 
 
 		 279 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 902 aa  57.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  32.79 
 
 		 678 aa  57  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 652 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 457 aa  57.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  49.18 
 
 		 361 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.94 
 
 		 2401 aa  56.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  38.67 
 
 		 137 aa  57  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 303 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 1759 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  38.67 
 
 		 137 aa  55.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  22.35 
 
 		 1359 aa  55.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 298 aa  55.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 616 aa  55.5  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>