210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1402 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  63.85 
 
 		 862 aa  1089    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  61.46 
 
 		 827 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 852 aa  1728    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 1312 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  35.7 
 
 		 1287 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 		 1314 aa  233  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1444 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 818 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 		 814 aa  202  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 		 1185 aa  201  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 746 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 		 1322 aa  194  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  40 
 
 		 1673 aa  193  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 818 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 		 1059 aa  190  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 1035 aa  190  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 1256 aa  189  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 987 aa  188  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 1313 aa  187  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  41.61 
 
 		 1317 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 		 995 aa  181  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  32.73 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 		 953 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 850 aa  151  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 1008 aa  144  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 1600 aa  118  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 1523 aa  89.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 1268 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 1162 aa  87.4  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 994 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 785 aa  85.1  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 1523 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 1435 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.75 
 
 		 2401 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 703 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 624 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 679 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 1106 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  29.96 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.67 
 
 		 860 aa  73.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  29.7 
 
 		 279 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 970 aa  72  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 303 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 1340 aa  68.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 		 1077 aa  67.8  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  22.14 
 
 		 1739 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 282 aa  67.4  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 305 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 902 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 313 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 311 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 345 aa  62  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.89 
 
 		 1119 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.81 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  26.78 
 
 		 342 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 1267 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 334 aa  60.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.7 
 
 		 322 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  22.5 
 
 		 297 aa  57.4  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25 
 
 		 320 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 301 aa  57.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 		 359 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 		 602 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 		 1152 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 832 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 270 aa  56.6  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 330 aa  56.6  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 318 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 717 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 557 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.8 
 
 		 358 aa  55.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  23.24 
 
 		 632 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  21.67 
 
 		 617 aa  56.2  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  22.82 
 
 		 296 aa  55.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 717 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 315 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>