More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0502 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
355 aa  735    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  58.26 
 
 
359 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  56.67 
 
 
358 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  57.36 
 
 
337 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  55.13 
 
 
353 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  55.49 
 
 
348 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  52.73 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
341 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  39.38 
 
 
338 aa  229  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
337 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
339 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  35.93 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  37.35 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  33.55 
 
 
330 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.41 
 
 
322 aa  206  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 
325 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  33.24 
 
 
838 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
841 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
822 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
318 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
836 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.02 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
345 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
337 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
841 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
339 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  28.79 
 
 
283 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
279 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
337 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  30.35 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.8 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
312 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.43 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
298 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
286 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
401 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
300 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
332 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
335 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
336 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
346 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
294 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
330 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
305 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
308 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1340 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
300 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
300 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
288 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
346 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
307 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.19 
 
 
1644 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
703 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.19 
 
 
1644 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.09 
 
 
2401 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
1317 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 
311 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
311 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
290 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
298 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
296 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
296 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
296 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
305 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
337 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
314 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.13 
 
 
700 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.28 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
528 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1077 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
301 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
994 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
1739 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
525 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
303 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
308 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>