More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2807 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
419 aa  854    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
785 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
1340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
1523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
1523 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
1162 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
1268 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
1435 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
499 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
457 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.38 
 
 
1119 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
1077 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
270 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  23.75 
 
 
700 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.98 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
658 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
679 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
1035 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
817 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.85 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
1739 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  24.33 
 
 
1059 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
624 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27 
 
 
338 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
282 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
703 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  23.21 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
841 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
902 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
987 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
994 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 
995 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
1256 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 
282 aa  67  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  22.9 
 
 
838 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
635 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
272 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
818 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 
1120 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  21.98 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
836 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
303 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 
273 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
299 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
1314 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
341 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
294 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 
340 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
297 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
303 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
525 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
616 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  24.5 
 
 
1673 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 
632 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
307 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  21.96 
 
 
1106 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
1008 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
753 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.46 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  20.63 
 
 
557 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
683 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  20.86 
 
 
303 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  22.15 
 
 
1075 aa  60.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.11 
 
 
358 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
1600 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 
340 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
1509 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
361 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
818 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.88 
 
 
2401 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  28.99 
 
 
267 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  21.79 
 
 
723 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
958 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
310 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
1312 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  22.03 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  24.02 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  22.75 
 
 
1444 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
298 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  22.32 
 
 
717 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>