More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4230 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  89.63 
 
 		 303 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  67 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  36.49 
 
 		 342 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  43.69 
 
 		 722 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 489 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  41.2 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  37.34 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  38.65 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 		 282 aa  159  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 		 1267 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 455 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 		 1267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  34.4 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  36.09 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  40.93 
 
 		 616 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 		 401 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 624 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 		 679 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 836 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  34.38 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 841 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  30.42 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 824 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 822 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  29.48 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  30.17 
 
 		 754 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.29 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 1162 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 1523 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  33.18 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>