269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2088 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 384 aa  753    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  54.96 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  48.32 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0979  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000658862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 1268 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 785 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 1256 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  26.4 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 680 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 703 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 576 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1444 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 1600 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 1435 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 1077 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 1486 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.78 
 
 		 2401 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 1739 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 1523 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 994 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 1340 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.1 
 
 		 1119 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 1523 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.66 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 1152 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 902 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 1314 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 1287 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  28.42 
 
 		 860 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 1152 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.88 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 1152 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 1162 aa  59.7  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 1312 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 1185 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5193  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 733 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 691 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 691 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 619 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  28.85 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 841 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 691 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 1317 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.38 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 321 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 1509 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 624 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  26.37 
 
 		 1644 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  26.37 
 
 		 1644 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  28.72 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 818 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 824 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>