202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2508 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  94.36 
 
 		 337 aa  661    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 337 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  47.66 
 
 		 345 aa  335  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 355 aa  279  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.02 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0979  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000658862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 1435 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 		 1119 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 1256 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 785 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  21.63 
 
 		 723 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.64 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 1523 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 818 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 		 1523 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 1268 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.94 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 		 902 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 1600 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.1 
 
 		 2401 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 1340 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 		 1162 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1444 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 1287 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 		 1739 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 1314 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 1077 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 1312 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 818 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 680 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 994 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  22.63 
 
 		 1152 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.21 
 
 		 703 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 		 610 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 1317 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 		 602 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  19.67 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  21.09 
 
 		 746 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  22 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 		 850 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.32 
 
 		 862 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 632 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 625 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  20.41 
 
 		 860 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 		 1486 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.22 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 814 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 841 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 539 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  21.7 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  22.81 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  23.34 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  25.47 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 852 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 		 824 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 1038 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 		 1162 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>