More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3180 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
322 aa  665    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  59.88 
 
 
335 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  57.28 
 
 
344 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  56.01 
 
 
338 aa  355  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 
331 aa  288  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  44.89 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.94 
 
 
336 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  43.06 
 
 
309 aa  230  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.32 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
305 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
333 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  27.27 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
528 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
477 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.56 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
924 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  26.35 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
428 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.04 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
233 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  33.64 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  25.23 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  26.78 
 
 
822 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  21.05 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  32.2 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.82 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 
1035 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  39.13 
 
 
1168 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  23.11 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  21.88 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.36 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  35.11 
 
 
1169 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  31.43 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.36 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.46 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  36.08 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.36 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
1177 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
1177 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.92 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
689 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  26.75 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  33.67 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.18 
 
 
694 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
777 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  25.54 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.58 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
660 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  37.37 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>