More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0044 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
746 aa  1499    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
1287 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  47.32 
 
 
1312 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  45.59 
 
 
1314 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  43.45 
 
 
1444 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
1185 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
1317 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  38.76 
 
 
1673 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
814 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
987 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  38.77 
 
 
1059 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
1035 aa  325  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
1256 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
995 aa  318  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 
1313 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
1322 aa  302  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
1008 aa  250  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
953 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  42.7 
 
 
723 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
827 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
852 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.42 
 
 
862 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
850 aa  189  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
818 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  33.51 
 
 
597 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
818 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
1600 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
1523 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
1523 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
1268 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
1162 aa  108  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
1435 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
680 aa  104  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
348 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
369 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
624 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
1340 aa  99.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
785 aa  98.6  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
679 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
658 aa  92.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
616 aa  89.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.63 
 
 
1119 aa  88.2  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  29.57 
 
 
279 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
359 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  30.3 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
270 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
1400 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
337 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.46 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
576 aa  72  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
1739 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
1067 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
280 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
970 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
305 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
332 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
994 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
339 aa  66.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
314 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
361 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
320 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
298 aa  65.1  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
300 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
410 aa  64.3  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
336 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
1077 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
1359 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
817 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
300 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4317  hypothetical protein  30.77 
 
 
489 aa  62  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
307 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
430 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.69 
 
 
358 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
315 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
325 aa  61.6  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 
703 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  16.61 
 
 
442 aa  60.8  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 
322 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
345 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
1267 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
328 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  29.2 
 
 
284 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
289 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
317 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
656 aa  59.3  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
617 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
311 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
307 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>