More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0185 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
305 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  49.17 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  45.52 
 
 
307 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 
321 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
298 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
302 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
303 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
314 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
300 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
318 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
305 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.1 
 
 
336 aa  130  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  29.2 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.8 
 
 
320 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  28.12 
 
 
330 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
341 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
841 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
359 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
401 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
342 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  31.54 
 
 
1119 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
319 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
294 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
293 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  32.16 
 
 
348 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  30.04 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
313 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
311 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
347 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  26.41 
 
 
342 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 
344 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
1267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.94 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
353 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
298 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.56 
 
 
284 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
311 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
378 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
342 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
455 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
282 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
489 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.06 
 
 
838 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.62 
 
 
283 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
355 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
327 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.23 
 
 
318 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
290 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
297 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
346 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
318 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
350 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
336 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
1267 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
328 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
318 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
282 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
841 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.41 
 
 
342 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.71 
 
 
700 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
308 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  28.98 
 
 
311 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.32 
 
 
652 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
306 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
679 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
308 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
836 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
705 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
722 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
310 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
325 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
345 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
288 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
318 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
286 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
299 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
1162 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
624 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>