235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0919 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
355 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.96 
 
 
384 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 
345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 
337 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  41.5 
 
 
337 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 
346 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0979  glycosyl transferase family 2  37.54 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000658862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
785 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
1256 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
1077 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
1523 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
1162 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
703 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
1523 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
1739 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
1340 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
680 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
1486 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
576 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
1268 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  23.69 
 
 
723 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
1152 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  24.34 
 
 
700 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
427 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 
1600 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
300 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  24.38 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
525 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
1435 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.89 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.51 
 
 
2401 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.79 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
270 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
624 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25.91 
 
 
1444 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.3 
 
 
1119 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  21.81 
 
 
658 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
1106 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  21.81 
 
 
994 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
1312 aa  56.2  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.72 
 
 
862 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 
902 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
597 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
506 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.72 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
616 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.5 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
274 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
401 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
297 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
311 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
988 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
1359 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  21.21 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
818 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
679 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.25 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
818 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
1152 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
882 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
1185 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
983 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
995 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
1152 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
619 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
340 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>