More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1316 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  100 
 
 
358 aa  749    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  61.86 
 
 
337 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  56.4 
 
 
359 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  56.67 
 
 
355 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  55.22 
 
 
348 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  52.37 
 
 
353 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  52.57 
 
 
350 aa  359  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  41.28 
 
 
338 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.11 
 
 
322 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  39.21 
 
 
341 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  38.34 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
337 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
339 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  38.24 
 
 
336 aa  206  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  42.75 
 
 
342 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 
340 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  40.35 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.82 
 
 
320 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
334 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
841 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.71 
 
 
838 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
836 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
313 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 
346 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
303 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  32.42 
 
 
283 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
822 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
328 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
311 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
336 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
291 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.63 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
841 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
298 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
340 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
298 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
282 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
279 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
305 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
302 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
312 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
346 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
317 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
303 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
313 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
342 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
332 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
324 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
288 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
1340 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
320 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
294 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  28.57 
 
 
860 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29.09 
 
 
291 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
325 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
994 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
290 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
296 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
296 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
296 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
703 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
324 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
902 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
311 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  27.19 
 
 
323 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.97 
 
 
652 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.32 
 
 
301 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.56 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.63 
 
 
1644 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.63 
 
 
1644 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
337 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
1739 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
1359 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
319 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>