More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3553 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 619 aa  1159    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 1340 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 880 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 703 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 		 410 aa  98.2  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 1077 aa  97.4  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.28 
 
 		 427 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 996 aa  96.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 717 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.1 
 
 		 610 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 525 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 670 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 1739 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  32.67 
 
 		 1837 aa  92.8  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 1152 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 785 aa  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 892 aa  90.5  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 717 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.73 
 
 		 2401 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 1359 aa  88.2  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 		 710 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 617 aa  87  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 		 809 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 691 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 679 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 857 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 824 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  34.57 
 
 		 1003 aa  81.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 1162 aa  81.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 624 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 808 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.91 
 
 		 1644 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 1067 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 796 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  32.91 
 
 		 1644 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 318 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 746 aa  79.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 1759 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 1152 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 1152 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 1486 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 684 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 328 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 775 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.87 
 
 		 860 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 721 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 1268 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 994 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 683 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 684 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  30.11 
 
 		 1182 aa  75.5  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  29.24 
 
 		 972 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 286 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 369 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 1038 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 1334 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 1106 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 902 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 1435 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 832 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 308 aa  72  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 625 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  29.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 958 aa  70.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>