More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4143 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  44.36 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.82 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 528 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  33.64 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  33.64 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  33.48 
 
 		 792 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  32.71 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  32.71 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  32.71 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  32.43 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  32.71 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  32.71 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  34.1 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  25.67 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.45 
 
 		 1225 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  36.19 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  41.24 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  26.96 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  39.05 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.58 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.33 
 
 		 1157 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  29.29 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  33.91 
 
 		 1169 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.65 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.58 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.74 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  31.63 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.19 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>