206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0930 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  58.27 
 
 
862 aa  960    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
827 aa  1670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  61.46 
 
 
852 aa  1014    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
1312 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
1287 aa  235  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
1314 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  33.76 
 
 
1444 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  31.57 
 
 
1185 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  43.02 
 
 
814 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 
746 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
818 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
818 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  41.82 
 
 
1673 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 
1322 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
1256 aa  191  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
1035 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 
1059 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
1313 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
1317 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
987 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  42.15 
 
 
953 aa  171  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  39.21 
 
 
995 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  30.29 
 
 
723 aa  157  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
850 aa  150  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  36.93 
 
 
1008 aa  134  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
1600 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
680 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
1523 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
994 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  29.09 
 
 
387 aa  88.6  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
1162 aa  85.9  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
1268 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
1523 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  29.23 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
624 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
679 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
785 aa  79.7  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
703 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
1106 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 
1435 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
353 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
616 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.72 
 
 
2401 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.53 
 
 
860 aa  72  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
303 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.92 
 
 
1119 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
1340 aa  68.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
305 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 
970 aa  66.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
282 aa  65.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
350 aa  65.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
314 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
902 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  22.04 
 
 
345 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.8 
 
 
358 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
359 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
324 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.46 
 
 
700 aa  61.6  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
298 aa  61.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 
632 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
457 aa  61.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
320 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
313 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.26 
 
 
320 aa  60.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
336 aa  60.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
360 aa  60.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
348 aa  60.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
324 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
293 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
324 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.53 
 
 
297 aa  59.3  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
892 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
302 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
318 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
705 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.99 
 
 
322 aa  58.5  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
334 aa  58.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
361 aa  58.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
324 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.58 
 
 
296 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
1077 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
311 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
1267 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
841 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  23.11 
 
 
297 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  26.87 
 
 
284 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  22.44 
 
 
731 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
658 aa  57  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
311 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 
1739 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
315 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
315 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
315 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
783 aa  55.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
280 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 
1359 aa  55.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>