More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3814 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 615 aa  1256    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  92.86 
 
 		 616 aa  1148    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 306 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3337  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 		 669 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1523 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 1523 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 342 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1676 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 878 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.94 
 
 		 810 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 3145 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 		 988 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 827 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 		 1056 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.76 
 
 		 725 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 		 632 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1852  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 825 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 792 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 909 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.18 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1406 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.82 
 
 		 1056 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.94 
 
 		 837 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 818 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.2 
 
 		 1764 aa  69.3  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.63 
 
 		 1022 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 3301 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.47 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1138 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 1252 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 3172 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.68 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.49 
 
 		 2240 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 		 875 aa  64.7  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.57 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.39 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24 
 
 		 732 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.35 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 1252 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.61 
 
 		 850 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1421 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.14 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 883 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.13 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 1737 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 879 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 3035 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.83 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 766 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 1562 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  25.09 
 
 		 623 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.14 
 
 		 622 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.19 
 
 		 2401 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.95 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  34.33 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.68 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1005 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.68 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  27.23 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 2262 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.36 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 968 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>