More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0378 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 342 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1852  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 825 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  47.81 
 
 		 1523 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  47.81 
 
 		 1523 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 		 1562 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 		 669 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 		 616 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 615 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3255  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 1009 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2866  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 1009 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.715807  hitchhiker  0.00303545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 703 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.07 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  22.12 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  25.45 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 1032 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  29.17 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 663 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 1035 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 812 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  25.35 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  24.75 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 		 872 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.26 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 1250 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  24.63 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 672 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 1476 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  18.79 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>