More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1852 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1852  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
825 aa  1642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
342 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  45.49 
 
 
1523 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  45.49 
 
 
1523 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0431  putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC  35.15 
 
 
1636 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 
1562 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
884 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 
669 aa  171  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
891 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
616 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
615 aa  93.2  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
361 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
347 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
269 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3255  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
1009 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2866  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
1009 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.715807  hitchhiker  0.00303545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
269 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
376 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
734 aa  76.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
303 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
703 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
346 aa  72  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
268 aa  70.5  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
898 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
898 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.52 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  25.33 
 
 
255 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
605 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 
310 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.04 
 
 
321 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  25.18 
 
 
708 aa  65.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.7 
 
 
295 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.71 
 
 
729 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
318 aa  65.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0637  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
386 aa  65.1  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.948946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
324 aa  64.7  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
322 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
335 aa  64.7  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
274 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
958 aa  64.7  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
315 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
405 aa  63.9  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
323 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
300 aa  63.9  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
872 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
280 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
233 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
1991 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
333 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  33.11 
 
 
391 aa  63.9  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
297 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
672 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 
337 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
296 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  26.86 
 
 
333 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
390 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
597 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
450 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
333 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
384 aa  62.4  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
316 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
455 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.01 
 
 
274 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
742 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
313 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
353 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
365 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  23.15 
 
 
343 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
327 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
369 aa  62  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1549  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
308 aa  62.4  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
280 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
983 aa  62  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  26.24 
 
 
334 aa  61.6  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
727 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
379 aa  61.6  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
364 aa  61.6  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.62 
 
 
326 aa  61.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
299 aa  61.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
334 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
367 aa  61.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
334 aa  61.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
324 aa  60.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  34.78 
 
 
343 aa  60.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1177 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>