More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3285 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
296 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  42.34 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  41.47 
 
 
303 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  42.92 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  42.6 
 
 
363 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  36.57 
 
 
334 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
316 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  41.44 
 
 
336 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 
320 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.31 
 
 
306 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  39.26 
 
 
287 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  36.51 
 
 
308 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
623 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
303 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
305 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  32.21 
 
 
1221 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.73 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  43.86 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
373 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  32.44 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
274 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
376 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.09 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
1250 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
280 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
398 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
324 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  39.69 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  44.35 
 
 
342 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  37.69 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3349  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114668  normal  0.646018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
373 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  40.52 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
663 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
703 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.79 
 
 
341 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
727 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.39 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  31.58 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
412 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0769  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
1035 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.26 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
930 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
1739 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  41 
 
 
1032 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>