More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3349 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3349  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
287 aa  590  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114668  normal  0.646018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
338 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
319 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  31.36 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
330 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
320 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
316 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
315 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.58 
 
 
1221 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
350 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.05 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  41.76 
 
 
1148 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  31.07 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.3 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.25 
 
 
853 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.52 
 
 
851 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.52 
 
 
851 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.52 
 
 
851 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  26.52 
 
 
851 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.52 
 
 
851 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  28.45 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  22.79 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  52.17 
 
 
1157 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
703 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
338 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
370 aa  65.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 
853 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.78 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  29.55 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 
853 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  27.93 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  30.1 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
377 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
609 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
358 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.95 
 
 
367 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  31.78 
 
 
333 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.71 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
335 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1032 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  32.61 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.35 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  34.44 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  31.62 
 
 
785 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  27.13 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
373 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
380 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  27.97 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.73 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
397 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
323 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
501 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  42.03 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  33.65 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.01 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  29.79 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  29 
 
 
386 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.73 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  29.79 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>