More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1241 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  100 
 
 		 306 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  54.77 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  65.14 
 
 		 181 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  54.26 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  46.46 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  44.49 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.55 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.55 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.95 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3780  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 376 aa  109  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.4 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.83 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.45 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  40.77 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  42.28 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  42.5 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  46.02 
 
 		 1157 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.09 
 
 		 380 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2583  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 809 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1239  hypothetical protein, CgtB glycosyltransferase fragment  100 
 
 		 49 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000538256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 250 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 		 334 aa  92.4  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  24.89 
 
 		 386 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36.31 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 403 aa  92.4  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  46.32 
 
 		 553 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.26 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  40.65 
 
 		 1173 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.29 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.89 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  28.99 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  45.76 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  34.78 
 
 		 785 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  33.07 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  31.28 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 		 366 aa  86.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.29 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 343 aa  85.9  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.38 
 
 		 729 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.94 
 
 		 1148 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.53 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.44 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.44 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.98 
 
 		 616 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.76 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1279  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  54.43 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.029641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 		 501 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  37.27 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  30.34 
 
 		 697 aa  82.8  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  33.58 
 
 		 1169 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1240  glycosyltransferase  30.19 
 
 		 401 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000000212379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0769  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0738  glycosyl transferase family 2  21.78 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0554497  hitchhiker  0.00271528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  35.04 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.2 
 
 		 731 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1480  putative glycosyltransferase  29.58 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285208  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1244  glycosyltransferase  33.54 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0087282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>