More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1085 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
329 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.92 
 
 
970 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  34.93 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 
358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.75 
 
 
326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.72 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.29 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.77 
 
 
731 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.66 
 
 
326 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
326 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
346 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  25.62 
 
 
325 aa  122  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.92 
 
 
729 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.47 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  32.13 
 
 
785 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.69 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.59 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  33.05 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  27.92 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1480  putative glycosyltransferase  37.63 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  29.37 
 
 
323 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  34.73 
 
 
386 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  43.2 
 
 
344 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  32.88 
 
 
333 aa  112  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  32.73 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
321 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  29.68 
 
 
1173 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  54.55 
 
 
318 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
376 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
553 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
329 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
616 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
343 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.78 
 
 
351 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.93 
 
 
323 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.31 
 
 
322 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  31.58 
 
 
319 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  30.14 
 
 
1169 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
355 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  35.16 
 
 
321 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
325 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.31 
 
 
328 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.41 
 
 
1157 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
689 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
322 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 
327 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
341 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.42 
 
 
1168 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
369 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
348 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.75 
 
 
353 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  32.76 
 
 
358 aa  102  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
295 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 
334 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  29.08 
 
 
334 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  46.3 
 
 
347 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.03 
 
 
1148 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  28.93 
 
 
346 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.86 
 
 
941 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
369 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  32.12 
 
 
301 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
334 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
324 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  51.96 
 
 
271 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.01 
 
 
300 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  28.31 
 
 
332 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  31.17 
 
 
672 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  38.41 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  40.87 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  40.87 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.87 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.87 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.87 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0716  putative sugar transferase  29.58 
 
 
448 aa  97.1  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  51.02 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
344 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
344 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>