More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1244 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1244  glycosyltransferase  100 
 
 
384 aa  774    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0087282  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1153  galactosyltransferase  71.74 
 
 
393 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00265504  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1242  glycosyltransferase  56.02 
 
 
389 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000038464  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1432  galactosyltransferase  51.9 
 
 
569 aa  318  9e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000251075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1433  putative sugar transferase  46.36 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000000125132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1240  glycosyltransferase  52.01 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000000212379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0715  galactosyltransferase  45.26 
 
 
486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0718  putative sugar transferase  35.33 
 
 
451 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1279  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.28 
 
 
402 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.029641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  64.63 
 
 
334 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
289 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  58.82 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  42.75 
 
 
697 aa  98.2  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  52.44 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  51.22 
 
 
325 aa  97.8  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  23.64 
 
 
785 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  46.34 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.94 
 
 
350 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.58 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
343 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  48.24 
 
 
301 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  48.91 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  54.43 
 
 
342 aa  87  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  47.31 
 
 
1168 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  49.41 
 
 
344 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  48.81 
 
 
353 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  49.41 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  48.19 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  32.84 
 
 
181 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.18 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  45.88 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  47.56 
 
 
1157 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  45.88 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  42.68 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  48.19 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  46.34 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  44.58 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  48.19 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  48.19 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
1116 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  45.24 
 
 
1148 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  44.05 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  50.59 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  48.19 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  48.19 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  48.19 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.55 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.55 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  48.19 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  42.55 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  47.56 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.78 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  43.9 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  45.78 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  42.55 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
553 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  41.46 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  48.19 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.55 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  47.56 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.55 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  33.54 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.31 
 
 
731 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  31.68 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  43.53 
 
 
616 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  48.81 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  43.53 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  48.78 
 
 
1035 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
337 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.49 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  47.67 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  46.34 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  48.24 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  45.88 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  33.8 
 
 
1169 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  42.55 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  42.17 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  42.35 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  46.34 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.73 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  45 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  48.1 
 
 
970 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  53.25 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
777 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>