More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3520 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
323 aa  670    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.73 
 
 
616 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
329 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
329 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
403 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
355 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  29.83 
 
 
306 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  27.67 
 
 
391 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 
344 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 
344 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 
344 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
324 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  29.28 
 
 
344 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
344 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 
344 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  29.28 
 
 
344 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 
344 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.17 
 
 
333 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
341 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
369 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.22 
 
 
270 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.94 
 
 
970 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
348 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  31.7 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  28.79 
 
 
785 aa  99  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  28.24 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.31 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  30.85 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.94 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  26.41 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.5 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  26 
 
 
386 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  32.77 
 
 
181 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.14 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.04 
 
 
946 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.48 
 
 
1157 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  27.39 
 
 
1173 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.46 
 
 
729 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  29.68 
 
 
358 aa  89.7  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1821  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000034803  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  29.02 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.27 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
340 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  30.09 
 
 
323 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1480  putative glycosyltransferase  33.86 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  31.53 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.96 
 
 
637 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  31.55 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
1116 aa  86.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
357 aa  85.9  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  23.92 
 
 
672 aa  85.9  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.71 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30 
 
 
952 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.88 
 
 
941 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  40.65 
 
 
697 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.88 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.1 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.24 
 
 
1168 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  28.57 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  31.19 
 
 
1169 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.71 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
573 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
573 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  27.31 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1362  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  27.83 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  40 
 
 
694 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3780  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
518 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
553 aa  82.4  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.1 
 
 
662 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
518 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  28.57 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>