More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4597 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
307 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  46.13 
 
 
311 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  44.49 
 
 
320 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 
246 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
364 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
338 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 
285 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  34.32 
 
 
308 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  30.89 
 
 
334 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 
330 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
348 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  38.35 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
338 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1484  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
257 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
277 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
853 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  36.42 
 
 
377 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  37.4 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
1007 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
623 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.33 
 
 
350 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
376 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.44 
 
 
853 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  29.71 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1035 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  41.67 
 
 
102 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.59 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  31.97 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
851 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
851 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
851 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
851 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  30.48 
 
 
851 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
983 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  36.09 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.1 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  26.95 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  33.86 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.27 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  43.3 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  43.75 
 
 
373 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
297 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.85 
 
 
643 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.46 
 
 
853 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>