More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0315 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
311 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  44.19 
 
 
348 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
303 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.59 
 
 
321 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  34.06 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
334 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
341 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
334 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
298 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.98 
 
 
241 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
309 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  30.73 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
332 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
1171 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.5 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
347 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
332 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.34 
 
 
331 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
338 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  33.62 
 
 
313 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
349 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
312 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
342 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.4 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
341 aa  99  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.71 
 
 
313 aa  95.9  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
367 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
1067 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  33.18 
 
 
237 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  30.73 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
280 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  30.14 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
352 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 
254 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  30.99 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
242 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
330 aa  92.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  31.25 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
398 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
256 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
330 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
390 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  29.86 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.91 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
365 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  25.83 
 
 
334 aa  89  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
581 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
338 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
625 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
625 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
801 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  33.52 
 
 
321 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 
294 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
632 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
376 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
276 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
573 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.7 
 
 
466 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
723 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
247 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  26.52 
 
 
350 aa  85.9  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
734 aa  85.9  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.96 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>