More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3866 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
325 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  38.44 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  38.14 
 
 
334 aa  222  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  48.2 
 
 
324 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  32.39 
 
 
332 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
334 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
350 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
334 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
349 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  39.19 
 
 
325 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
348 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 
331 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.68 
 
 
321 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.79 
 
 
326 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 
241 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  34.29 
 
 
339 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
242 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
298 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  32.61 
 
 
237 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  31.62 
 
 
332 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
252 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
247 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
390 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
313 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.51 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
1171 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  28.06 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  28.16 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  30.9 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28.51 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.78 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.74 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  29.28 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  22.98 
 
 
983 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.67 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.15 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
596 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  26.22 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
581 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
801 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.2 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
727 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
501 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
1035 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0704  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439605  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.46 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  27.52 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>