More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0237 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  100 
 
 
334 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  43.41 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  41.16 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
325 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
341 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 
334 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
349 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  31.83 
 
 
332 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  39.21 
 
 
350 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  43.18 
 
 
325 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
331 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
306 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
321 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 
348 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  35.22 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  36.44 
 
 
339 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
303 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.86 
 
 
241 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
313 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
234 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
309 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  30 
 
 
237 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
312 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
247 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.21 
 
 
313 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  30.96 
 
 
313 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  31.47 
 
 
332 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  32.03 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
256 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
322 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
1171 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 
337 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.53 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
703 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
544 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.93 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  27.85 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.37 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
596 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.8 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  25.93 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.53 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.05 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  23.81 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  30.51 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  25.11 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  23.01 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
970 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>