More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1067 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 337 aa  698    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  55.7 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  54.79 
 
 		 308 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  45.31 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  34.32 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  29.64 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  34.53 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.23 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1171 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  31.6 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.53 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  32.34 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  29.82 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  28.76 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  26.41 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.9 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.11 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  28.51 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  42.86 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 1239 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  34.23 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.61 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 801 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  26.32 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.9 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  28.51 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 983 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.05 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  27.05 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  27.43 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.27 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.27 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  27.07 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>