265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1933 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.63 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 322 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  29.39 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.53 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.91 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.76 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.43 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.11 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  29.56 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.17 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  25.83 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  28.29 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  35.51 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.58 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  25.52 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.15 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.43 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 341 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 146 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  31.68 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.79 
 
 		 326 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  30.77 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.79 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 355 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  29.2 
 
 		 334 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 684 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  29.25 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.54 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 377 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>