251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4055 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
307 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  63.23 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  58.75 
 
 
306 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 
300 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  46.21 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
299 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
308 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
329 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.21 
 
 
337 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 
298 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.18 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  25.81 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.48 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.63 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  30.97 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  27.95 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  26.27 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
398 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  26.53 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.2 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.48 
 
 
853 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  29.63 
 
 
851 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  27.97 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.46 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
397 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
853 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.38 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
386 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  25.32 
 
 
237 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  23.43 
 
 
350 aa  59.3  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
318 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
853 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.11 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.11 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  25.88 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  22.58 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.17 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
374 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  31.53 
 
 
334 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
249 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
344 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
390 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
247 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.72 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2047  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
105 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  21.66 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
376 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
347 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
325 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  30.71 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
376 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.78 
 
 
241 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 
573 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
329 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.01 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
801 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>