More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1334 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 300 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  50.4 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  47.46 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  44.56 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.24 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.88 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  28.7 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  30.84 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  25 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  28.11 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.23 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  33.06 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  26.23 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  26.01 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.19 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.57 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  25.21 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  26.05 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  35.78 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.18 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.18 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  23.63 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.43 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.64 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>