More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4052 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 329 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.7 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  55.23 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  47.21 
 
 		 322 aa  288  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  29.8 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.27 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  32.96 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  29.73 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  30.83 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  28.95 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  27.43 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  29.83 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.66 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.47 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 1171 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.61 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  27.83 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.51 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  27.75 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  22.18 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  24.33 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 1239 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.05 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.03 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  26.81 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  27.16 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  20.68 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  36.04 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  26.95 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1715  protein CgeD  23.29 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.79 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  21.79 
 
 		 746 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  31.31 
 
 		 102 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  26.9 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.43 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>