More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2174 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 308 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.44 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  40.61 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  40.61 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  39.55 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  37.31 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  36.53 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  41.52 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  35.87 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.81 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.03 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.98 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  33.05 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 311 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 		 241 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  32.58 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  30.73 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1171 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.36 
 
 		 254 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.22 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  41.18 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.76 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  36.11 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  35.4 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  28.7 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>