More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1509 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
331 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.12 
 
 
325 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
349 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  31.2 
 
 
334 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
350 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
325 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  33.48 
 
 
332 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.17 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.05 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  31.8 
 
 
339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
234 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
309 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
311 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.09 
 
 
311 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
247 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
348 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
242 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
256 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
1171 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.24 
 
 
326 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  31.3 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
252 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
313 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  30.88 
 
 
287 aa  87.8  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.48 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
801 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  34.33 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  27.56 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  26.42 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  26.36 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  29.32 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.11 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  35.29 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.97 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  33.9 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
418 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.05 
 
 
643 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  26.15 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  31.06 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.35 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
597 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
1035 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
296 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
476 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>